基于肿瘤微环境基因构建IIII期结肠癌

今天解读一篇发表在EBioMedicine上的文章，影响因子6.68。文章通过建立了一个肿瘤微环境风险评分panel,并证明其可作为I-III期结肠癌患者生存预测和治疗指导的有效工具。文章标题ArobustpanelbasedontumourmicroenvironmentgenesforprognosticpredictionandtailoringtherapiesinstageI-IIIcoloncancer

摘要：

背景：肿瘤微环境（TME）对于癌症发展和治疗的调节至关重要。本研究的目的是开发基于TME相关基因的可靠的预后模型。

方法：通过使用五个有临床信息的芯片数据集。使用leastabsoluteshrinkage方法和selectionoperatorregression方法来减少维数，识别可靠的预后基因。

结果：作者建立了一个预后panel(由个基因组成)，称为肿瘤微环境风险评分（TMRS）。通过特定的风险评分公式，TMRSpanel具有通过单变量和多变量分析预测无复发生存期和总生存期的强大能力。与TNM分期相比，TMRSpanel显示出更高的预测准确性。进一步的分析表明，TMRS评分较高的患者在辅助化疗中未显示出治疗效果，这可能是由于基质相关途径的激活和基质细胞的浸润所致。除了结肠癌，TMRSpanel还被证明是胃癌预后预测和化学治疗决策的可靠工具。在转移性尿路上皮癌患者和黑色素瘤患者组成的数据集中也证实了其在预测免疫治疗结果中的价值。

结论：TMRSpanel基因可能是I-III期结肠癌患者生存预测和治疗指导的有效工具。

结果简述

1

结肠癌患者特征和鲁棒的预后基因识别

本研究中，使用了五个GEO数据集（GSE，GSE，GSE，GSE和GSE）的名诊断为I-III期结肠癌的患者样本。中位年龄为69岁（22–97岁），其中名患者（48.6％）为男性。其中，RFS信息可用于例患者，平均生存期为个月。名患者的OS信息，平均生存期为个月。过滤得到个基因（其表达水平与预后稳定且显著相关）最终被鉴定为可靠的预后基因。

2

使用TME相关的可靠预后基因构建分子亚组

首先，使用无监督的聚类方法，基于个可靠的预后基因将个肿瘤样品分为不同的分子亚组。最终确定了两个簇，分别称为肿瘤微环境簇1（TMEC1）和肿瘤微环境簇2（TMEC2），并且两个簇之间来自不同GEO系列的患者比例的比较显示无显著差异。通过对数秩检验，Kaplan–Meier曲线表明，两个簇之间RFS和OS存在明显的生存差异。如下图所示：进一步

转载请注明：http://www.nwsaj.com/zljcl/30695.html